高通量测序对原发性胆汁性胆管炎患者个体水平外周血B细胞受体免疫球蛋白重链互补决定区3免疫组库特征的初步研究

作者：赵丹彤; 郭昌龙; 闫惠平; 廖慧钰; 刘燕敏; 张海萍; 安丽莎; 黄春洋; 韩莹; 赵艳^*

来源：中华肝脏病杂志, 2017, 25(11): 847-851.

DOI：10.3760/cma.j.issn.1007-3418.2017.11.009

• 肝硬化, 胆汁性
• B细胞受体
• IGH-CDR3免疫组库

目的分析原发性胆汁性胆管炎(PBC)患者个体水平外周血B细胞受体免疫球蛋白重链互补决定区3(IGH-CDR3)免疫组库特征, 了解其免疫系统多样性的特点。方法采用扩增子救援多重PCR(arm-PCR)技术特异性扩增一例PBC患者外周血B细胞受体, 即膜表面免疫球蛋白重链IGH-CDR3区核苷酸序列, 通过第二代高通量测序技术进行测序, 结合生物信息学分析其免疫组库特征。结果共测得序列数329 219个, 总CDR3序列为325 540个, 独特CDR3序列为72 774个, D50为7.7;IGH-CDR3区长度主要为45个核苷酸(nt)(9.6%), N区添加的核苷酸数量频率最高的为13～14 nt(5.25%), J基因片段末端去除的核苷酸数主要是0(12.7%);V基因使用频率最高的前3个等位基因是V4-59(9.5%), 其次为V3-23(8.1%)和V1-69(6.4%)。结论该PBC患者IGH-CDR3免疫组库多样性程度较低, 存在个别克隆异常增殖情况, 该特异性有待扩大样本量进一步验证。

• 单位
  国家卫生计生委科学技术研究所; 首都医科大学附属北京佑安医院