宏基因组二代测序技术对腹部创伤合并腹腔感染的诊断价值

作者：邓云烜; 丁威威^*; 刘宝晨; 杨超; 解廷斌

来源：创伤外科杂志, 2023, 25(11): 816-823.

• 腹部创伤
• 腹腔感染
• 宏基因组二代测序

目的 探究宏基因组二代测序(meta-genomic next-generation sequencing, mNGS)对腹部创伤合并腹腔感染(intra-abdominal infection, IAI)的诊断价值。方法 回顾性分析2020年8月—2022年4月南京大学医学院附属金陵医院普通外科ICU收治且符合纳入/排除标准的37例腹部创伤(腹部简明损伤定级标准评分≥3分)疑似合并IAI患者，男性30例，女性7例；年龄29～67岁，平均49.4岁。患者均留取血液及腹腔引流液进行微生物培养及mNGS检测，收集其临床资料，比较微生物培养和mNGS两种检测方法在阳性结果报告时间、阳性预测值、阴性预测值、灵敏度、特异度以及不同类型感染检出率方面的差异。结果 37例腹部创伤疑似合并IAI的患者中，32例的病原学检测结果为阳性，共检出革兰氏阴性菌36种，革兰氏阳性菌11种，真菌10种，检出率前三的革兰氏阴性菌依次为肺炎克雷伯菌、鲍曼不动杆菌及大肠埃希菌，检出率最高的革兰氏阳性菌为肠球菌属，真菌为念珠菌属，结合临床确诊为IAI;其余5例诊断为非IAI。IAI组与非IAI组在取检时间(d)、APACHE II评分(分)及ICU住院时间(d)上存在显著差异[13(7,24)vs.3(1,7)、 12(6,16)vs.5(4,8)、 13(8,27)vs.5(3,8),P<0.05]。对于腹腔引流液样本，mNGS的阴性预测值及灵敏度均显著高于微生物培养(1.000 vs.0.343、1.000 vs.0.192,P<0.001),而阳性预测值及特异度低于微生物培养(0.600 vs.1.000、0.941 vs.1.000,P>0.05),受试者工作曲线的曲线下面积分别为0.800及0.672(P<0.05)。对于血液样本，mNGS的阴性预测值及灵敏度均显著高于微生物培养(0.444 vs.0.147、0.843 vs.0.094,P<0.001),而阳性预测值及特异度低于微生物培养(0.964 vs.1.000、0.800 vs.1.000,P>0.05),受试者工作曲线的曲线下面积分别为0.822及0.547(P<0.05)。此外，mNGS对混合感染的检出率显著高于微生物培养(84.4%vs.28.1%,P<0.001),并且mNGS的阳性结果报告时间更短(22.0h vs.61.5h,P<0.05)。结论 在腹部创伤合并IAI的患者中，mNGS表现出良好的诊断性能，但诊断特异度及阳性预测值低于微生物培养，可作为临床常规微生物检测方法的补充共同指导临床治疗。未来需要更进一步的研究来表明其具体临床获益。

• 单位
  南京大学