m6A阅读器IGF2BP1在胰腺癌中的表达及意义

作者：欧阳永灏; 易思清; 辛万鹏; 孙根; 方康; 涂书举; 肖卫东^*

来源：南昌大学学报(医学版), 2023, 63(01): 27-33.

DOI：10.13764/j.cnki.ncdm.2023.01.005

• N~6-甲基腺嘌呤
• 胰岛素样生长因子2-mRNA结合蛋白1
• 胰腺癌
• 生物信息学
• 预后

目的 利用生物信息学分析探讨N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)阅读器胰岛素样生长因子2-mRNA结合蛋白1(IGF2BP1)在胰腺癌组织中的表达情况及其临床意义。方法 从GEO和TCGA两数据库m6A相关基因的差异分析结果中筛选出本研究的目标基因IGF2BP1后，通过HPA、UALCAN网站对IGF2BP1蛋白质水平的表达情况进行分析。利用UALCAN网站分析IGF2BP1的表达与临床病理的关系。通过LinkedOmics网站对IGF2BP1进行共表达分析及GSEA富集分析。STRING网站被用于构建IGF2BP1的蛋白互作(protein-protein interaction, PPI)网络。使用Kaplan-Meier Plotter数据库对IGF2BP1及与其有蛋白互作关系的基因进行Kaplan-Meier生存分析。结果 IGF2BP1在胰腺癌组织中高表达且表达水平与胰腺癌患者TP53的突变有关(P<0.05)。共表达分析显示1226个基因与IGF2BP1呈正相关，825个基因与IGF2BP1呈负相关(P<0.01)。GSEA分析显示这些共表达基因主要参与生物调节、代谢、对刺激物的应答等过程，行使与蛋白质、离子和核酸结合等功能。在m6A相关基因的PPI网络中，IGF2BP1与多个m6A相关基因有着蛋白互作关系。Kaplan-Meier分析显示，IGF2BP1及多个与其有着蛋白互作关系的基因表达水平与胰腺癌患者的预后呈负相关(P<0.05)。结论IGF2BP1的表达水平在胰腺癌组织中显著增高，且与胰腺癌不良预后有关，有望成为胰腺癌诊治的潜在新靶点。

• 单位
  南昌大学第一附属医院