利用SELEX技术筛选小檗碱核酸适配体及其亲和力表征

作者：张丽娜; 赵鹏; 田国英; 田平芳^*

来源：北京化工大学学报(自然科学版), 2018, 45(06): 48-52.

DOI：10.13543/j.bhxbzr.2018.06.008

• 小檗碱
• 指数富集的配基系统进化技术(SELEX)
• 核酸适配体

小檗碱是一种价格低廉且生物安全性良好的小分子化合物,筛选能与小檗碱互相作用的核酸片段,旨在开发新型遗传元件并拓展其在生物技术领域的应用。利用指数富集的配基系统进化技术(SELEX),经8轮实验从随机单链DNA文库中筛选出4条能与小檗碱高度特异性结合的核酸适配体。对其中两条重现性较好的适配体进行结构模拟分析表明,适配体序列富含鸟嘌呤和胞嘧啶且多形成茎环及G-四链体结构。亲和力测定结果显示,其中的2条核酸适配体与小檗碱作用的解离常数Kd都处于nmol级,表现出较高的亲和力,适配体S1的Kd值最小,仅为523 nmol/L,与小檗碱亲和力最大。

• 单位
  石家庄市农林科学研究院; 北京化工大学