甲型H1N1流感(2009)病毒福州株全基因组序列分析

作者：陈智伟; 姚栩; 张彩云; 杨建娜; 郑能雄

来源：中国卫生检验杂志, 2011, (08): 1960-1963.

• 甲型流感病毒
• 全基因组序列
• 分子特征
• 序列分析
• 进化树 Influenza A H1N1 virus
• Complete genome sequence
• Molecular characteristics
• Sequence analysis
• Phylogenetic tree

目的:分析福州地区甲型H1N1流感病毒株的全基因序列和遗传特征。方法:采用MDCK细胞培养法和Real-time RT-PCR法对A/Fuzhou/721/2009(H1N1)进行病毒分离、鉴定。测定该株的全基因组序列,并进行基因进化树分析。结果:分离株的8个基因片段核苷酸和推导氨基酸序列与其他地区新甲型H1N1参考株的同源性都在99%以上;与参考株A/California/04/2009相比,HA蛋白有4个氨基酸发生了突变,分别位于83、1972、03和321位点上,HA1蛋白都有6个潜在糖基化位点;对耐药性位点分析发现,对金刚烷胺类药物耐药,但仍然对神经氨酸酶抑制剂类药物敏感。结论:该毒株与2009年大流行株高度同源;相对于以往古典型猪流感代表株出现了HA蛋白抗原性漂移,但HA蛋白保留了古典猪H1的特点。对福州地区甲型H1N1(2009)流感病毒全基因序列和分子遗传特征的详细研究,为监测病原变异、致病性及流行规律提供科学依据。

• 单位
  福州市疾病预防控制中心