武汉地区丙型肝炎病毒包膜蛋白E1的生物信息学研究

作者：周小东; 万莉; 蔡国才; 雷行华

来源：华中师范大学学报(自然科学版), 2018, 52(03): 366-372.

DOI：10.19603/j.cnki.1000-1190.2018.03.013

• 丙型肝炎
• 生物信息学
• 武汉
• 包膜蛋白E1

使用生物信息学的方法,分析武汉地区不同基因型、亚型的丙肝病毒的包膜E1蛋白,预测其二级结构、核苷酸变异性、糖基化位点、亲水性、跨膜区、信号肽、蛋白修饰位点、B细胞抗原.结果显示各HCV的包膜E1蛋白二级结构差距不大;序列始末段有数个氨基酸残基的差距,序列上存在高变异位点,基因型2a的型内一致性最高;序列大量糖基化,有多个糖基化基化位点;序列分布着亲水性区域,基因型1b的分值很高;基因型1b、6a、3b、3a多数亚型有1个跨膜区,基因型2a多数亚型有两个跨膜区;基因型1b、6a、3b、3a无信号肽,基因型2a都有信号肽;蛋白序列上存在多个不同修饰位点和B细胞抗原,各基因型、亚型之间有明显差距,具有较大异质性.该研究为揭示病毒感染机制和研制地区性疫苗提供一定的科学依据.

• 单位
  成都医学院; 绵阳市第三人民医院