不同OTUs划分阈值对湖泊浮游细菌α多样性的影响

作者：沈烽; 黄睿; 王司辰; 曹新益; 赵大勇

来源：化学与生物工程, 2016, 33(02): 25-30.

• α多样性
• 高通量序列
• OTUs
• 浮游细菌
• 16SrRNA

微生物研究中,湖泊浮游细菌微生物群落的α多样性通过OTUs(operation taxonomy units)来分析评价。考察了现有手段下不同OTUs划分阈值或分类单元"属"水平对α多样性大小和趋势的影响,并推断了分类单元"属"所对应的OTUs划分阈值。通过454高通量测序技术研究了南京莫愁湖、前湖、玄武湖、紫霞湖4个湖泊的浮游细菌微生物群落,探讨了不同OTUs划分阈值对α多样性指数OTUs、Chao1、Invsimpson、Shannon的影响。结果发现,OTUs划分阈值不同,OTUs和Chao1指数变化一致,Invsimpson和Shannon指数变化一致;在不同的OTUs划分阈值下,4个湖泊的OTUs和Chao1指数在不同季节的排序基本保持不变,Invsimpson和Shannon指数在不同季节的排序发生改变。表明,分类单元"属"所对应的OTUs划分阈值在0.060.08范围内;原有的以0.03或0.1阈值划分OTUs来分析α多样性是合理的;所用的分析微生物群落α多样性方法是全面的、可靠的。

• 单位
  河海大学; 水文水资源与水利工程科学国家重点实验室