福建省新型冠状病毒的分离和全基因组特征分析

作者：张炎华; 陈炜; 何文祥; 吴冰珊; 朱颖; 王金章; 游丽斌; 黄枝妙; 陈宏彬; 俞婷婷; 鄢育青; 吴晶晶; 修文琼; 袁平; 张小鸿; 骆婧; 翁育伟^*; 郑奎城^*

来源：中国人兽共患病学报, 2020, 36(05): 349-353.

• 新型冠状病毒
• 病毒分离
• 全基因组

目的从福建省早期新型冠状病毒肺炎(COVID-19)病例中分离新型冠状病毒(2019-nCoV)并了解病毒基因组特征。方法将福建省早期COVID-19患者的咽拭子样本接种至Vero-E6细胞,培养上清提取核酸,经real-time RT-PCR法验证后,利用Ion Torrent S5深度测序仪做全基因组测序,分析病毒株全基因组序列与参考序列的一致性和进化情况。结果12份咽拭子样本经培养后有2份样本病毒滴度明显上升,表明分离到2株2019-nCoV,其全基因组结构蛋白与Wuhan-Hu-1株的一致性超过99.9%。结论成功自福建省早期COVID-19病例中分离到2019-nCoV,病毒分离株的基因序列与湖北武汉流行的2019-nCoV高度同源,提示病毒尚未发生明显变异。

• 单位
  福建医科大学; 公共卫生学院; 福建省疾病预防控制中心