基于SNP标记的爆裂玉米农家品种遗传多样性

作者：曾艳华; 谢和霞; 江禹奉; 周锦国; 谢小东; 周海宇; 谭贤杰; 覃兰秋^*; 程伟东^*

来源：作物杂志, 2020, (05): 65-70.

DOI：10.16035/j.issn.1001-7283.2020.05.010

• 爆裂玉米
• 种质资源
• 农家品种
• SNP基因芯片
• DNA分型

为了评价广西爆裂玉米农家品种的遗传多样性,利用56K SNP芯片技术对中国广西45个爆裂玉米农家品种、中国2个爆裂玉米杂交种和6个南美爆裂玉米种质进行全基因组扫描,获得多态性标记14 338个,基因分型为6种类型。其中A/G类型最多,为5 805个;A/T类型最少,为149个。1号染色体的多态性SNP位点最多,为2 302个;10号染色体最少,为848个。45个农家品种间平均遗传相似系数为0.62,变幅为0.41～0.99,总体遗传相似度高。聚类分析将参试品种划分为三大类群,相同来源的农家品种大多聚在一起;主成分分析显示大部分农家品种聚在一起,与杂交品种和南美品种之间没有交集,表明农家品种遗传相似性较高,与杂交品种和南美品种遗传差异较大。

• 单位
  广西壮族自治区农业科学院玉米研究所