细粒棘球绦虫AgB5抗原表位的生物信息学预测

作者：刘学磊; 刘玉梅; 曹文艳; 兰希; 彭珊珊; 王倩; 丁剑冰; 马秀敏

来源：中国病原生物学杂志, 2015, 10(01): 38-41.

DOI：10.13350/j.cjpb.150109

• 细粒棘球绦虫
• 抗原B
• 抗原表位
• 生物信息学

目的应用计算机在线预测软件分析细粒棘球绦虫AgB5抗原蛋白的二级结构,预测其可能形成的B细胞表位和T细胞表位,为研制安全、高效的新型包虫病基因疫苗奠定基础,也为包虫病的免疫学治疗提供新的理论依据。方法采用计算机在线预测软件SOPMA对细粒棘球绦虫AgB5抗原蛋白的二级结构进行预测和分析;采用LEPS和ABC Pred网络软件结合其表面特性、亲水性、柔韧性、可及性、可塑性等对其B细胞表位进行预测和分析;采用IEBD和SYFPEITHI在线软件对细粒棘球绦虫AgB5抗原蛋白的MHC-I类HLA-A 0201限制性T细胞表位进行预测和分析。结果采用计算机在线预测软件预测细粒棘球绦虫AgB5抗原蛋白的二级结构中α螺旋结构占76.47%,β-折叠占5.88%,无规则卷曲占17.65%。结合其表面特性、亲水性、柔韧性、可及性以及可塑性等分析得出分值较高的3个B细胞表位区域,分别为:614、2833和4852氨基酸序列,较易形成B细胞表位;通过MHC-I类HLA-A 0201限制性T细胞表位分析得出分值较高的4个T细胞表位区域,分别为:913、2429、3845和5159氨基酸序列,较易形成T细胞表位。结论通过生物信息网络技术方法分析确定细粒棘球绦虫AgB5抗原蛋白分别存在3个B细胞抗原表位和4个T细胞抗原表位,可为细粒棘球绦虫AgB抗原性研究和高效表位疫苗研发提供参考,为临床包虫病的免疫诊断、药物治疗提供新的靶标。

• 单位
  基础医学院; 新疆医科大学; 新疆医科大学第一附属医院