假单胞菌Y5-11的分离筛选及比较基因组学研究

作者：韩国秀; 王素蕾; 张彦龙^*; 曾伟民^*; 李季; 穆雨彤; 麦智源; 张多英

来源：黑龙江大学自然科学学报, 2023, 40(05): 545-554.

DOI：10.13482/j.issn1001-7011.2022.09.117

• 假单胞菌
• 分离
• 比较基因组
• 生理生化特征
• 脂肪酸

菌株Y5-11是从哈尔滨周边地区地下水中分离的一株假单胞菌，具有较高的自养脱氮能力。菌株Y5-11的16S rRNA基因序列与模式菌Pseudomonas koreensis Ps 9-14T高度同源(99.72%)。获得了菌株Y5-11的全基因组序列，采用比较基因组学分析了菌株Y5-11的碳源利用和脂肪酸含量特征，对菌株的生理生化特征进行了系统研究，发现菌株Y5-11与模式菌Pseudomonas koreensis Ps 9-14T在碳源利用上较为接近，但两株菌株在生长温度和硝酸盐还原方面存在差异。菌株Y5-11有17个特有基因，其在脂肪酸种类及含量上与其他菌株相比，存在明显的特异性，主要脂肪酸为C16:0和C17:0 cyclo,含量分别为19.37%和21.09%。通过以上研究，确定了菌株Y5-11的分类地位和生物学特征，为菌株Y5-11的进一步应用提供了生物学参考依据。

• 单位
  黑龙江大学; 建筑工程学院; 生命科学学院