基于SNP标记的504份番茄种质资源遗传多样性分析

作者：宋丽娜; 王晓敏^*; 刘文娟; 杨宏; 付金军; 胡新华; 高艳明; 李建设

来源：核农学报, 2022, 36(12): 2366-2387.

• SNP标记
• KASP技术
• 番茄
• 种质资源
• 遗传多样性

为深入了解番茄种质资源的遗传多样性，运用竞争性等位基因特异性PCR(KASP)技术，利用前期筛选出的60对多态性较高的单核苷酸多态性标记(SNP),对收集的504份番茄种质资源进行遗传多样性分析、聚类分析、主成分分析及群体结构分析。结果表明，60个SNP分子标记共检测到181个等位基因，基因多样性平均值为0.450,期望杂合率(He)平均值为0.069,多态性信息值(PIC)变化范围为0.171～0.583,平均值为0.381。在遗传距离为0.36时，504份番茄材料被划分为7个类群，各材料间的平均遗传距离为0.62;根据主成分分析结果将群体分为3个类群；基于SNP标记对参试材料进行群体结构分析，在K=3时，504份番茄种质资源被划分为3类。本研究筛选出的60对SNP标记的多态性为中度偏高，番茄种质资源遗传多样性较丰富，可为后续宁夏地区番茄的核心种质构建及种质资源的有效利用提供理论依据。

• 单位
  宁夏大学