随着分子生物学的深入研究以及蛋白质组学技术的发展,对蛋白质的研究已从简单的蛋白质化学发展到蛋白质组学阶段,质谱技术已成为蛋白质组学研究中的重要工具和核心技术。而基于质谱技术的蛋白质组学已开始成熟,这为生命活动规律的研究提供了手段,为临床应用的研究提供给了新的思路和方法。文章综述了近年来基于质谱的新兴蛋白质组学的研究及其最近的突出应用,并对其发展前景进行展望。