玉米ZmPRR1-1基因启动子的克隆及序列分析

作者：仝帧翰; **青; 张严玲; 王雷立; 李安然; 董柯清; 王闻琦; 王盼盼; 王翠玲^*

来源：作物研究, 2022, 36(04): 354-362.

DOI：10.16848/j.cnki.issn.1001-5280.2022.04.12

• 玉米
• PRR基因
• 启动子
• 克隆
• 生物信息学分析

克隆玉米伪应答调控基因ZmPRR1-1启动子并对其序列进行分析，以期为深入研究ZmPRR1-1基因的调控机制及基因功能提供参考。以玉米黄早4的叶片为供试材料，参考已公布玉米自交系CML247基因组中ZmPRR1-1启动子的序列信息设计引物，克隆ZmPRR1-1基因的启动子，并利用生物信息学对启动子中的核心区域、顺式作用元件、转录因子结合位点和CpG岛进行预测分析。克隆得到长度约2 600 bp的ZmPRR1-1启动子，预测ZmPRR1-1启动子可能存在2个核心启动子区域，除了存在核心元件TATA-box和启动子增强元件CAAT-box外，还存在光响应、激素应答、胁迫响应等顺式作用元件。转录因子结合位点分析表明，ZmPRR1-1启动子区中预测包含ERF在内的6种转录因子家族，此外在启动子区域中预测存在4个符合限定条件的CpG岛区域。玉米ZmPRR1-1启动子区域存在丰富的顺式作用元件和转录因子结合位点，暗示ZmPRR1-1可能受到外界多种类型调控因子的调控并启动转录起始，且在多种调控网络中发挥功能。

• 单位
  河南科技大学