Illumina MiSeq高通量测序降解黑龙江绥化地区玉米秸秆细菌菌群的研究

作者：徐丽萍; 姜喆; 葛英亮^*; 孙宏文

来源：食品工业科技, 2018, 39(23): 105-110.

DOI：10.13386/j.issn1002-0306.2018.23.019

• Illumina MiSeq测序
• 玉米秸秆
• 细菌菌群
• 降解

以研究黑龙江绥化地区农产废弃物玉米秸秆细菌降解菌群为目的,采用Illumina MiSeq微生物多样性测序的方法,对2015～2017年玉米秸秆的菌群多样性进行测序。采用生物信息学的方法对低温自然降解秸秆细菌群落中主要降解菌进行分析,并筛选了2015～2017年玉米秸秆中两株丰度最高的纤维素降解细菌,经多次分离纯化并结合刚果红染色法验证其低温降解纤维素的功能。结果表明,测序获得61564385 bp,质控后共141219条16S rDNA序列,Silva数据库比对到14门、29纲、70目、136科、282属。其中假单胞菌属(Pseudomonas)、根瘤菌属(Rhizobium)、德沃西亚菌属(Devosia)、黄杆菌属(Flavobacterium)、微杆菌属(Microbacterium)和链霉菌属(Streptomyces)等是降解秸秆的主要细菌菌株,即该地区玉米秸秆细菌菌群多样性丰富,且研究筛选出的两株细菌具有纤维素降解能力。

• 单位
  哈尔滨工业大学; 哈尔滨学院; 哈尔滨商业大学