环湖牦牛瘤胃微生物区系特征及性别之间的差异

作者：韩学平; 刘宏金; 胡林勇; 徐世晓^*; 艾德强; 付弘贇; 陈永伟; 赵建忠

来源：动物营养学报, 2020, 32(01): 234-243.

• 牦牛
• 16S rDNA
• 瘤胃
• 微生物区系
• 性别
• TAX4FUN

本试验旨在研究环湖牦牛瘤胃微生物区系特征及性别之间的差异。随机挑选4～5岁环湖牦牛健康公牛5头[平均体重为(228. 0±19. 4) kg]和母牛5头[平均体重为(198. 0±8.4) kg],采用16S rDNA扩增子高通量测序的方法研究公、母牦牛瘤胃微生物区系特征和性别之间的差异。结果表明:2个性别间瘤胃微生物在门水平上组成相似,其中拟杆菌门(Bacteroidetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)和厚壁菌门(Firmicutes)是优势菌门,样品中平均相对丰度分别为51.74%、15.00%和14.34%。在属水平上,普氏菌属1(Prevotella1)、理研菌科RC9肠道群(RikenellaceaeRC9gutgroup)和普雷沃氏菌科UCG-001(PrevotellaceaeUCG-001)是优势菌属,平均相对丰度分别为16.11%、7.74%和3.43%。Alpha多样性指数中,公牛的Sobs指数为2 689,极显著高于母牛(P <0.01),其余指数无显著性别差异(P> 0. 05)。主坐标分析(PCoA)和相似性分析(Anosim)结果说明2个性别之间瘤胃微生物区系存在明显差异。在属水平上,公牦牛RikenellaceaeRC9gutgroup的相对丰度显著高于母牦牛(P<0.05),母牦牛Prevotella1、毛螺菌科AC2044群(LachnospiraceaeAC2044group)、Saccharofermentans、Anaerovorax和Elusimicrobium的相对丰度显著高于公牦牛(P<0.05)。瘤胃微生物TAX4FUN预测功能比较发现,公、母牦牛瘤胃微生物功能在糖类代谢、氨基酸代谢、脂肪代谢及疾病相关等功能存在差异。从上述分析来看,性别对牦牛瘤胃微生物区系的组成有显著影响,尤其是在属水平上差异较大。

• 单位
  中国科学院西北高原生物研究所; 中国科学院大学; 青海省农牧业工程项目咨询中心; 青海省畜牧总站