宏基因组学技术可以清楚的认识环境中微生物的组成和丰度、发现新基因、明晰基因的功能、探究微生物和环境的相互作用,能够更准确地反映微生物生存的真实状态,极大地扩展微生物资源的利用空间。本文从生物信息学的角度介绍了宏基因组的分析策略,常用软件、流程和在线分析平台,为宏基因组学分析提供方法上的参考。