针对以往的软件序列对比操作过程复杂,以及对比算法的时空复杂度不如人意等的问题,提出一种针对软件行为踪迹分析的序列两两对比算法,该方法在兼顾分析效率的同时达到分析的准确性。实验结果表明,基于被研究的序列对比算法在分析行为序列的效率和准确性上具有综合优越性。