茶树CsIQD基因家族的鉴定和表达模式分析

作者：练珊珊; 张宝会; 姚新转; 吕立堂^*

来源：特产研究, 2021, 43(05): 26-34.

DOI：10.16720/j.cnki.tcyj.2021.112

• 茶树
• IQD基因家族
• 生物信息学分析

IQD蛋白家族是一类钙调素结合靶蛋白,在植物的生物防御和发育调节中都发挥着重要的作用。为探明茶树中CsIQD基因家族的基本特征,揭示CsIQD基因在茶树中的表达模式,本研究基于茶树基因组数据,利用生物信息学软件对茶树CsIQD家族成员的基因结构、进化关系、保守域及染色体定位等进行分析,并通过Xia等的茶树转录组数据明确了CsIQD在茶树不同组织部位以及PEG诱导的干旱和盐胁迫下的基因表达情况。结果表明,从茶树基因组中共鉴定到38个CsIQD基因,它们在不同的染色体上不均匀地分布排列,按其亲缘关系可分为Ⅳ个蛋白簇,相同亚家族的基因结构和保守结构域相似;分析CsIQD基因在茶树不同组织和胁迫下的表达模式发现,CsIQD基因在芽和嫩叶中有较高的表达,部分基因在花和茎中也有较高表达,在PEG诱导的干旱和盐胁迫下,CsIQD间存在基因的表达差异,因此,CsIQD基因参与了茶树的整个生长过程,同时也是激发茶树非生物胁迫能力的重要调控因子。本研究初步解析了茶树CsIQD基因家族的基本特征和功能,为进一步研究茶树的生长发育调控机制奠定了理论基础。

• 单位
  贵州大学