基于霍乱毒素B亚单位结构功能分析的霍乱弧菌基因分型

作者：王志刚; 朱水荣; 张俊彦; 阮卫; 程洁; 贾红宇; 包其郁; 张政

来源：中国卫生检验杂志, 2010, (09): 2137-2140.

• 霍乱弧菌
• 霍乱毒素
• 基因型
• 信息频谱法 Vibrio cholerae
• Cholera toxin
• Genotype
• Informational spectrum method

目的:描述和分类自然发生的霍乱毒素B亚单位DNA和蛋白序列的多态性,及时提供潜在有用的霍乱诊断、疫苗研制和流行病学信息。方法:采用生物信息频谱分析平台,同时包括Clustal W,MEGA和PyMOL分析法,对245个霍乱毒素B亚单位DNA和蛋白序列进行结构和功能及基因分型特性的研究。结果:所分析的霍乱毒素B亚单位的103个氨基酸区域有共同的信息频谱特征,其主峰特征为F(0.3333,19),显示了霍乱菌株的霍乱毒素B亚单位的共同作用模式。霍乱毒素B亚单位蛋白的T68I氨基酸残基关键变异明显增加了F(0.3333)的特征峰高,可能对"人类"作用的模式有较大影响。经过系统聚类分析,发现了19个霍...

• 单位
  浙江出入境检验检疫局; 浙江省疾病预防控制中心; 温州医科大学; 浙江大学