铁死亡相关基因的乳腺癌预后评估模型构建

作者：岳涛; 贺青卿^*; 庄大勇; 周鹏; 李小磊; 徐婧

来源：中华实验外科杂志, 2023, 40(04).

• 乳腺癌
• 铁死亡基因
• 生物信息学分析
• 预后模型

目的筛选乳腺癌铁死亡相关基因, 建立乳腺癌铁死亡相关基因的预后风险预测模型。方法通过"DESeq2"软件包进行差异分析, 单因素Cox回归、Lasso分析、多因素Cox回归分析以及森林图确定独立风险因子, 并建立基于铁死亡相关基因的乳腺癌预后预测模型, 并对模型效能进行评价。最后通过基因富集分析(GSEA)展示高低风险组信号通路富集结果差异。结果以log2|Fold Change|>1, P<0.05为差异分析标准, 筛选得到乳腺癌组织中差异表达的铁死亡基因89个。通过Cox回归以及森林图, 成功构建乳腺癌铁死亡基因预后风险评分模型。模型5年总体生存率ROC曲线下面积(AUC)在肿瘤基因组图谱(TCGA)中为0.753。GSEA结果显示, 以标准化富集分数(NES)>1, NOMP<0.05, FDRq<0.25为筛选标准, 高风险组富集到了19个京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路。结论本研究构建的乳腺癌预后评估模型对乳腺癌患者的预后具有一定预测能力。