小细胞肺癌相关基因的生物信息学分析

作者:张婕; 戴巍; 冯宇; 叶佳琪
来源:电脑知识与技术, 2020, 16(34): 14-16.
DOI:10.14004/j.cnki.ckt.2020.3866

摘要

运用生物信息学方法分析小细胞肺癌的相关基因,选取GEO数据库基因芯片数据集GSE66635进行深入挖掘,通过GEO2R筛选差异表达基因,并利用R软件对其进行聚类分析、DAVID数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析、STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白质相互作用网络,最终得到6个关键基因:TP53,CCL2,FGF2,FOS,FGFR4,PGF,其所参与的生物学过程等可能与小细胞肺癌的发生、发展相关。

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