菠菜雌雄同株性状的全基因组关联分析

作者：汪豪英; 刘志远; 王晓武; 武剑; 张合龙; 夏志兰; 徐兆生^*; 钱伟^*

来源：园艺学报, 2019, 46(08): 1495-1502.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0081

• 菠菜
• 全基因组
• 关联分析
• 雌雄同株

菠菜为典型的雌雄异株植物,少数植株表现为雌雄同株。为了挖掘控制菠菜雌雄同株的基因位点,对82份菠菜高代自交系的性型进行调查分析,同时进行测序深度为10×的重测序。重测序共获得了3 420 496个SNP,过滤后得到1 621 970个多态性高的SNP位点。利用高质量的SNP对菠菜雌雄同株的性状进行了全基因组关联分析(GWAS)。利用压缩混合线性模型(compress mixed linear model,cMLM)在菠菜4号染色体上检测到1个强关联区域。基于强关联信号SNP位点LD值(31.2kb)的大小,将控制菠菜雌雄同株的基因Xm定位在64.6kb的区间内。该范围内存在3个基因:Spo24600、Spo24601和Spo24602。该研究在关联区域内开发了KASP标记,可以有效用于菠菜雌雄同株的鉴定。

• 单位
  中国农业科学院蔬菜花卉研究所; 湖南农业大学