dRNA-seq原理及其在原核生物转录组学研究中的应用

作者：侯志伟; 王赟; 高宏; 侯圣伟

来源：遗传, 2013, (08): 983-991.

• dRNA-seq
• 转录组测序
• 小RNA
• 转录起始位点
• 非编码RNA dRNA-seq
• transcriptome sequencing
• sRNA
• TSS
• ncRNA

第二代测序技术不仅推进了基因组学的研究,而且也广泛应用到转录组学的研究中。原核生物转录组学的研究方法主要有Tiling芯片和RNA-seq,后者因其较高的覆盖率和分辨率以及越来越低廉的成本而逐渐被更多的研究单位采用。根据对mRNA富集方法或rRNA去除方法的不同,目前RNA-seq方法主要有6种,其中dRNA-seq由于采用了5′单磷酸依赖的外切酶,可以特异性地降解加工过的转录本,从而使初始转录本得到富集,已被广泛应用到原核生物转录起始位点、小的调控RNA、启动子及操纵子等研究中。文章对dRNA-seq的原理、技术流程及其在原核生物转录组学研究中的应用进行了综述,并对这一研究方法在现阶段应用的...

• 单位
  中国科学院大学; 中国科学院水生生物研究所; 淡水生态与生物技术国家重点实验室; 河南城建学院