两种肠道腺病毒基因型分型方法的比较

作者：阳莉; 卢建溪; 王强; 黄建华; 周才

来源：中国热带医学, 2010, 10(11): 1301-1303.

DOI：10.13604/j.cnki.46-1064/r.2010.11.018

• 腺病毒
• 基因型
• 病毒分离
• 流行病学
• 序列分析

目的研究简便快速肠道腺病毒基因型分型方法。方法采集137例非腹泻人群的粪便样本,在A549细胞中培养,提取病变细胞的基因组DNA进行PCR扩增或直接提取粪便悬液过滤上清基因组DNA进行巢式PCR扩增,对PCR阳性者进行克隆、测序以及基因型分型。结果 137份样本中,两种方法均有17份样本检出腺病毒,阳性率为12.4%(17/137)。序列分析显示,两种方法检出的腺病毒型别一致。这17份样本分别属于人腺病毒5型(5份)、7型(3份)、12型(3份)及48型(6份)。结论两种方法的敏感性、特异性一样,但方法二是直接提取粪便悬液过滤上清基因组DNA进行巢式PCR扩增,无需方法一需进行3次体外细胞感染实验后从病变细胞中提取基因组DNA进行PCR扩增,节省实验的时间及成本,特别是避免体外细胞感染过程中可能出现的污染,值得推荐。

• 单位
  中山大学附属第三医院; 广东省妇幼保健院