生物信息学模型在丙型病毒性肝炎肝硬化肝癌中的应用

作者：汪炳瑞; 刘卓然; 杨卫平; 沈柏用; 彭承宏; 邱伟华

来源：中华实验外科杂志, 2015, 32(10): 2333-2337.

DOI：10.3760/cma.j.issn.1001-9030.2015.10.004

• 生物信息学
• 数据库
• 基因组学
• 网络
• 蛋白质组学
• 肝癌

目的 利用生物信息学技术,分析和处理相关高通量数据,查找或建立丙型病毒性肝炎导致肝癌发生相关的基因、蛋白质调控网络以及pathway功能注释信息,建立肝癌蛋白质网络,从而阐释丙型病毒性肝炎相关性肝癌动态发展机制.方法 通过文本挖掘技术对数据收集及整理,利用倍数变化(FC)方法对GEO数据库中肝癌相关3组基因表达谱芯片进行分析,计算差异表达基因,得到和肝癌相关的数据信息.从GEO数据库中获取两组

• 单位
  上海交通大学医学院附属瑞金医院