山羊EGR4、KDM4C和KDM6A多态性及其与繁殖性能关联分析

作者：李昆谕; 刘玉芳; 陶林; 江炎庭; 欧阳依娜; 储明星^*; 洪琼花^*

来源：特产研究, 2023, 45(01): 6-13.

DOI：10.16720/j.cnki.tcyj.2022.087

• 山羊
• 繁殖性状
• SNPs
• EGR4
• KDM4C
• KDM6A

本研究旨在分析EGR4、KDM4C和KDM6A单核苷酸多态性（SNPs）与山羊繁殖性状的关联。利用MassARRAY?SNP分型技术对EGR4、KDM4C和KDM6A的SNPs位点进行分型，检测其在云上黑山羊（n=544）、济宁青山羊（n=133）和辽宁绒山羊（n=91）3个群体中的遗传学特征，并将其多态性与繁殖性状表型（产羔数、初生窝重、断奶窝重）进行关联分析。群体遗传学结果表明，EGR4 g.11029053G> T和g.11029600T> A位点在云上黑山羊中为中度多态（0.25 A位点在3种山羊群体中为低度多态（PIC <0.25）;KDM4C g.37764228T> A位点在济宁青山羊中为中度多态（0.25 A和g.37768026C> G位点在3种山羊群体中为低度多态（PIC <0.25）;KDM6A g.27177505C> A在济宁青山羊和辽宁绒山羊中为中度多态（0.25 A、g.11029053G> T和g.11029600T> A位点在3种山羊群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P> 0.05）;KDM4C g.37764228T> A、g.37767773T> A和g.37768026C> G在3种山羊群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P> 0.05）;KDM6A g.27102554T> A和g.27177505C> A位点分别在辽宁绒山羊中和济宁青山羊中处于Hardy-Weinberg不平衡状态（P <0.05），在云上黑山羊中处于Hardy-Weinberg平衡状态（P> 0.05）。关联分析结果表明，在云上黑山羊中EGR4 g. 11029600T> A位点TT型的初生窝重和断奶窝重显著高于AA型（P <0.05）;KDM4C g.37764228T> A位点TT和TA型的产羔数、初生窝重和断奶窝重显著高于AA型（P <0.05）;KDM6A g.27177505C>A位点CC型产羔数显著高于CA型和AA型（P <0.05）,g.27102554T> A位点TT型的初生窝重和断奶窝重显著高于AA型（P <0.05）。综上所述，EGR4 g.11029600T> A、KDM4C g.37764228T> A和KDM6A g.27102554T> A位点可作为云上黑山羊窝重选择的潜在分子标记；KDM4Cg.37764228T> A和KDM6Ag.27177505C> A位点可作为云上黑山羊产羔数选择的潜在分子标记。

• 单位
  云南省畜牧兽医科学院; 生命科学与食品工程学院; 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所; 河北工程大学