<正>多序列比对是识别未知基因功能、基因间保守区域的有效方法。随着基因测序技术的快速发展,基因序列数据的快速增长,现有比对算法和软件已不能有效解决大规模的多序列比对问题。该文对传统的星比对算法做了比对精度上的改进,通过引入Profile比对模式,并结合树比对的指导树比对方法,