利用SLAF-seq结合BSA方法发掘大豆种皮色相关基因

作者：郁晓敏; 金杭霞; 杨清华; 傅旭军; 郭丹丹; 吕晓男; 袁凤杰^*

来源：分子植物育种, 2021, 19(02): 385-391.

DOI：10.13271/j.mpb.019.000385

• 大豆
• 种皮色
• 重测序
• 关联分析

种皮色不仅是一个形态标记,还是一种重要的进化性状,与大豆商品性、营养价值以及抗性关系密切。本研究以黄色种皮大豆品系BMY及其褐色种皮衍生品系BMZ为亲本,从F2群体中分别挑选出黄色种皮和褐色种皮的植株各9株,构建了两个极端性状混合池DNA文库,借助SLAF-seq和BSA技术,挖掘大豆种皮色性状相关候选基因。对于26 121个高质量SNP位点,利用SNP-index方法和ED方法进行综合分析,获得8个与目标性状紧密关联的候选区域,分别位于第5、11、12、19和20染色体,包含620个编码基因。对这620个基因进行进一步的功能注释,NR、Swiss-Prot、GO、KEGG和COG数据库分别注释到600、518、533、133和256个基因,其中存在非同义突变基因4个,分别为Glyma05g005600、Glyma05g009700、Glyma12g006100和Glyma12g047300。候选区域内编码基因的深度注释有助于功能基因的进一步分离,为大豆种皮色性状相关基因的精细定位及克隆提供理论依据。

• 单位
  浙江省农业科学院; 浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所