人食管鳞状细胞癌细胞株hsa-miR-143/145基因簇表达生物学信息的分析

作者：蒋森; 杨晓娣; 王秀芳; 鲍子超; 付海龙; 杜云翔; 赵亚萍

来源：中华肿瘤防治杂志, 2012, (23): 1790-1794.

DOI：10.16073/j.cnki.cjcpt.2012.23.015

• 食管肿瘤
• hsa-miR-143/145基因簇
• 细胞系
• 计算生物学 esophageal neoplasms
• hsa-miR-143/145 cluster
• cell line
• computational biology

目的:探讨hsa-miR-143/145基因簇在人食管鳞状细胞癌(ESCC)细胞株中的表达,并对其生物学特征以及功能进行预测分析。方法:通过实时荧光定量PCR法,检测人ESCC细胞株KYSE-150和正常食管上皮细胞株Het-1A中hsa-miR-143/145基因簇的相对含量;应用miRBase获取并分析hsa-miR-143/145基因簇序列特征并比较其同源性大小;应用TargetScan 6.1、PicTar及miRanda预测hsa-miR-143/145基因簇的靶基因,取三者预测结果的交集,并结合已证实的靶基因进行功能注释(GO)和通路富集分析。结果:人ESCC细胞株KYSE-150...

• 单位
  蚌埠医学院; 上海交通大学医学院附属瑞金医院; 中国人民解放军第八二医院