基于协方差估计的多因变量回归模型的多性状QTL定位研究

作者：张慧; 叶景山; 申佳瑜; 刘慧铭; 尹宁; 李立婷; 温永仙^*

来源：西北农林科技大学学报(自然科学版), 2022, 50(09): 135-143.

DOI：10.13207/j.cnki.jnwafu.2022.09.016

• 数量性状
• QTL定位
• 多因变量
• 协方差估计
• 回归模型

【目的】基于协方差估计的多因变量回归(multivariate regression with covariance estimation, MRCE)模型进行多性状QTL定位分析，为动植物数量性状基因定位提供理论参考。【方法】构建适用QTL定位的MRCE模型，设计3个模拟试验对模型进行检验，通过计算机生成基因型和2个相关性状的表型值，并用2组数据对模型进行实际应用，其中一组为水稻DH群体数据，选自qtlnetwork软件；另一组为水稻永久F2群体数据，由珍汕97×明恢63,含有210个株系的重组自交系(RIL)群体随机交配生成，分析MRCE模型在以上2组数据多性状QTL定位中的应用效果。【结果】用MRCE模型进行QTL定位的模拟试验结果表明，遗传变异所占方差比越大，相关系数绝对值越大，遗传率越大，则功效越好，估计值越接近效应值。MRCE的QTL定位应用结果显示，从水稻DH群体中识别出8个QTL与ph6性状有关，6个QTL与ph8性状有关；从1998年水稻永久F2群体数据中识别出3个QTL与穗粒数相关，10个QTL与粒质量相关；从1999年数据识别出3个QTL与穗粒数相关，6个QTL与粒质量相关。【结论】利用MRCE模型进行多性状QTL定位是可行的。

• 单位
  福建农林大学; 厦门华厦学院