摘要
目的通过检测SLE患者长链非编码RNA(lncRNA)的表达变化, 初步探索差异表达的lncRNA与调节性T细胞(Treg)数量间的联系, 分析Treg相关lncRNA与SLE患者临床特征间的相关性, 预测lncRNA调节Treg分化发育的机制, 为SLE的治疗提供新思路。方法收取9例活动期SLE患者外周血, 提取PBMCs, 用全转录组测序分析PBMCs的lncRNA表达谱, 以9名健康人作为对照组, 筛选差异表达的lncRNA, 采用Pearson检验分析lncRNA与Treg数的相关性, 以及Treg相关lncRNA与SLE患者SLEDAI评分、ESR、C3、C4之间的相关性, 用miRcode和Targetscan数据库及共表达网络预测Treg相关lncRNA的靶向基因。结果与健康对照组相比, SLE患者有240个差异表达lncRNA, 包括134个高表达的lncRNA(P<0.05), 106个低表达的lncRNA(P<0.05), 其中ANKRD44-AS1(r=0.74, P=0.022)、LINC00200(r=0.70, P=0.037)、AP001363.2(r=0.78, P=0.014)、LINC02824(r=0.79, P=0.011)的表达量与外周血Treg数目呈正相关, AP000640.1(r=-0.72, P=0.028)、AC124248.1(r=-0.77, P=0.016)、LINC00482(r=-0.83, P=0.005)、MIR503HG(r=-0.96, P<0.001)的表达量与外周血Treg数目呈负相关, 在这8种Treg相关lncRNA中, LINC00482(r=-0.73, P<0.05)、MIR503HG(r=-0.76, P<0.05)的表达量与C3呈负相关。与Treg相关的LINC00200、ANKRD44-AS1、AP000640.1通过竞争性结合miRNA或反式调控机制调控信号传导及转录激活因子5(STAT5)、磷脂酶D1(PLD1)、单一顺式结构蛋白X(HOPX)、Runt相关转录因子3(RUNX3)的表达, 进而调控Treg的分化发育。结论 SLE患者lncRNA表达谱发生变化, 差异表达的lncRNA与SLE患者Treg数量和功能异常有关, 并且Treg相关lncRNA与SLE疾病活动相关, 其可能通过竞争性结合miRNA或反式调控机制影响STAT5、PLD1、HOPX、RUNX3的表达, 调节Treg功能, 参与SLE的发病和疾病进展。
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单位山西医科大学第二医院