苏×柯杂交猪肠道不同部位菌群结构的研究

作者：杨莲; 燕志宏^*; 吴光松; 顾丽菊; 张芸; 江冰; 谢宗福; 廖志莹

来源：生物技术, 2021, 31(03): 245-216.

DOI：10.16519/j.cnki.1004-311x.2021.03.0038

• 苏×柯杂交猪
• 肠道菌群
• 高通量测序
• 生物信息学分析
• alpha多样性分析

[目的]为了研究苏×柯杂交猪肠道不同部位菌群结构。[方法]9头苏×柯杂交猪在同等条件下养殖,达屠宰体重后(100 kg左右),随机选3头屠宰,取十二指肠、空肠、回肠、结肠肠道内容物,进行高通量测序和生物信息学分析。[结果]结果表明,苏×柯杂交猪结肠和小肠段Alpha多样性指数差异显著(P <0.05);肠道菌群结构分析显示,厚壁菌门(> 63.78%)和变形菌门(> 3.02%)在苏×柯杂交猪小肠肠道菌群中占绝对优势,厚壁菌门(59.45%)和拟杆菌门(33.51%)构成苏×柯杂交猪结肠优势菌门;瘤胃球菌属、拟普雷沃菌属、密螺旋体属等纤维降解菌属在结肠的相对丰度显著高于小肠段(P <0.05),LEf Se分析,发现苏×柯杂交猪结肠肠道富集着大量的产短链脂肪酸菌群。[结论]随着肠道自上而下,苏×柯杂交猪肠道菌群丰富度和多样性逐渐增加;在属水平上,苏×柯杂交猪结肠和小肠段中纤维降解菌表现出差异,结肠内纤维降解菌的比例较高,说明小肠段对粗纤维的消化能力较弱于结肠。

• 单位
  动物科学学院; 贵州大学