藜麦热激蛋白60（CqHSP60）基因家族生物信息学和表达模式分析

作者：陈方军; 刘文莉; 杨博; 彭悦; 丁洪霞; 宫瑗; 尹海波; 郭善利^*

来源：烟台大学学报(自然科学与工程版), 2023, 1-10.

DOI：10.13951/j.cnki.37-1213/n.221114

• 藜麦
• HSP60
• 表达模式
• 胁迫
• 伴侣蛋白

为了探究藜麦HSP60基因（CqHSP60）的结构特征、基因功能和表达模式，本研究基于藜麦全基因组和转录组数据，利用生物信息学方法对CqHSP60基因家族进行鉴定和系统分析。依据亚细胞结构定位分为了三个亚组，每个亚组具有相似的Motif和基因结构；通过RNA-Seq数据对CqHSP60基因在不同发育阶段进行了表达分析，并对在热、干旱、盐胁迫等不同处理条件下CqHSP60基因的胁迫响应进行了分析，结果表明CqHSP60基因在花簇和干种子中表达量较高，并对不同的胁迫模式均有响应；在CqHSP60基因的启动子区发现了多个与胁迫相关的顺式调控元件，这表明这些基因在多重胁迫下受到应激响应。

• 单位
  烟台大学; 生命科学学院