中国山羊痘弱毒疫苗AV41株基因组分子标记的比较分析

作者：陆游; 南文龙; 巩明霞; 李林; 邹艳丽; 吴晓东; 彭大新^*; 陈义平^*

来源：中国兽药杂志, 2021, 55(06): 1-7.

• 山羊痘弱毒疫苗
• 牛结节性皮肤病
• 分子标记

为鉴别我国山羊痘病毒(GTPV)弱毒疫苗AV41株与牛结节性皮肤病病毒(LSDV)野毒株,运用生物信息学方法将AV41株基因组全序列与GenBank中已发表的LSDV、GTPV和绵羊痘病毒(SPPV)基因组进行比较,筛选AV41株基因组分子标记。采用我国不同厂家来源的AV41株疫苗测序验证分子标记相关序列,并与我国LSDV野毒株相应位置序列比较。结果显示,通过基因组比较分析共筛选获得分子标记19个,经测序确认其中7个为AV41株基因组独特分子标记,包括DNA ligase基因2433A2434、Kelch-like protein基因1831A1832、GTPVgp020基因G203A、GTPVgp021基因C681T、DNA-binding viron core protein基因C47T、RNA polymerase subunit基因T64C和Myristylated protein基因C746A,而我国LSDV野毒株相应位置序列未见上述变化。本研究揭示了AV41株基因组独特分子标记分布情况,可用于我国牛结节性皮肤病疫情防控中与LSDV野毒株的分子鉴别。

• 单位
  中国动物卫生与流行病学中心; 扬州大学