构建基于自噬相关lncRNAs皮肤黑色素瘤预后模型

作者：刘洁; 徐刚林; 罗金菊; 杨珺涵; 李月; 柳梦婷; 杨珮珮^*

来源：武汉大学学报(医学版), 2023, 44(01): 92-98.

DOI：10.14188/j.1671-8852.2021.0679

• 皮肤黑色素瘤
• 自噬
• lncRNA
• TCGA
• 预后

目的：构建预测皮肤黑色素瘤（SKCM)预后的自噬相关长链非编码RNA(lncRNAs)风险模型，寻找与SKCM预后相关的新的生物学标志物。方法：从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获得SKCM的lncRNAs的表达谱，以构建自噬基因与lncRNAs共表达网络。Lasso回归和多因素Cox回归寻找与自噬相关lncRNAs。根据自噬相关lncRNAs建立风险评分，并使用Cox回归检验其是否为独立的预后因素。利用GO和KEGG分析自噬相关lncRNAs的功能富集。结果：SKCM中鉴定出有11个自噬相关lncRNAs，其中7个（USP30-AS1、HCP5、WAC-AS1、EBLN3P、AL162171.1、LINC00339、THCAT158）是保护性因素，4个（LINC00518、AC009570.1、AC009495.2、LINC00665）是危险因素。根据风险评分Kaplan-Meier生存分析发现，高风险组SKCM预后明显差于低风险组，差异有统计学意义（P<0.001）。Cox回归提示风险评分（HR=1.333,95%CI:1.214～1.465,P<0.001）是影响SKCM患者预后的独立危险因素。风险评分在预测SKCM患者10年生存率的ROC曲线下面积分别为0.799。功能分析显示11个自噬相关lncRNAs主要与细胞分裂以及机体细胞的免疫相关，而且肿瘤发生、发展和复发转移的相关信号通路也出现富集情况。结论：基于11个自噬相关lncRNAs构建风险评分以及预后模型对SKCM预后具有一定的预测价值，为SKCM靶向治疗提供治疗靶点和参考。

• 单位
  荆楚理工学院; 荆门市第二人民医院