一些联结主义者一直将联结主义模型与神经生物学之间的结构和加工相似性，作为其生物合理性的根据。但是这些生物合理性的说明是成问题的：一方面，加工相似性是高度简化的，并且加工相似性对于认知解释并不是充分和必要的；另一方面，联结主义中的一些主要功能及算法示例，目前还不能找到神经生物学基础。所以联结主义和经典主义一样，是一种与实现层面无关的认知功能描述。
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