基于混池测序的犬恐惧行为相关变异位点的初步筛选

作者：朱程程; 马大君; 程占军; 曹锦和; 孙勇; 万宁; 李翔

来源：畜牧与兽医, 2020, 52(10): 127-131.

• 混池测序
• 犬
• 恐惧行为
• 变异位点

为了初步筛选与犬恐惧行为相关的变异位点,对6～8月龄的犬进行严格的恐惧行为测试,根据测试结果选取恐惧行为极端差异的史宾格犬20头,分为高恐惧行为组(FBH)和低恐惧行为组(FBL),每组各10头,采用混池测序的方法检测史宾格犬全基因组的单核苷酸多态性位点(SNP)和插入缺失位点(InDel),筛选与史宾格犬恐惧行为相关的变异位点。结果显示:通过特定条件的筛选,FBH组和FBL组存在差异的SNPs共14个,InDels共2个,这16个位点位于9个基因上。研究表明,通过混池测序的方法可以初步筛选出与犬恐惧行为相关的变异位点,进一步分析确定与恐惧行为遗传效应相关的变异位点,可以为犬遗传育种改良提供理论依据。

• 单位
  公安部南京警犬研究所