飞行时间质谱法检测肉兔IGF-IR基因的多态性

作者：梅秀丽; 邝良德; 郭志强; 李娟; 黄邓萍; 谢晓红; 雷岷; 李丛艳^*

来源：中国养兔杂志, 2021, (01): 4-15.

• 肉兔
• IGF-IR基因
• 飞行时间质谱
• SNPs

应用MassARRAY单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF-MS)基因分型法检测肉兔胰岛素样生长因子1受体(Insulin-like Growth Factor 1 Receptor, IGF-IR)的多态性(SNPs),为今后建立肉兔辅助标记选择奠定基础。以家兔IGF-IR基因序列为模板,利用PCR扩增测序法筛查了肉兔IGF-IR基因的9个SNPs。为进一步验证筛选的准确性,应用MALDI-TOF-MS针对384只肉兔检测了5个SNPs。结果显示,平均检出率为98%,能够准确检测出3种常见的基因型。所检SNP位点的平均最小等位基因频率(MAF)为0.45,平均多态信息含量(PIC)为0.36。本研究运用的方法快速、可靠、准确度高,为以后开展肉兔生长性状基因的SNP分型和检测等奠定了基础。

• 单位
  成都市农林科学院; 四川省畜牧科学研究院