小麦旗叶相关性状全基因组关联分析

作者：徐鑫; 王玉洁; 李小军^*; 朱效辉; 刘晓蓓

来源：麦类作物学报, 2023, 43(12): 1514-1523.

• 小麦
• 旗叶相关性状
• 关联分析

为发掘小麦旗叶性状相关基因位点，以384个小麦品种(系)为材料，对2个年份获得的旗叶长、宽、面积、长宽比和55K SNP芯片分型数据进行全基因组关联分析。结果发现，共检测到60个与旗叶性状显著关联的SNP,分布于除了1D、2A、4D和6D外的17对染色体上，解释表型变异的4.11%～9.70%,平均为5.64%。与旗叶长、宽、面积、长宽比相关的位点分别有12、24、18和16个，其中10个SNP为多性状相关位点。旗叶长相关SNP中，7D染色体上的3个SNP(AX-110826147、AX-111061288和AX-111843581)与2个年份旗叶长及其平均值均显著相关，1个SNP(AX-108882010)与2018年旗叶长及2个年份平均值均显著相关，这4个SNP位于7D染色体63.48～67.45 Mb区段，SNP标记间R2的平均值为0.78(P<0.000 1),呈现较大的连锁不平衡。遗传效应分析发现，该区段存在8种单倍型，其中单倍型III和IV在2个年份的旗叶长基本一致，分别为18.30和18.20 cm,高于其他6种单倍型的旗叶长；这2种单倍型分别占供试材料的40.36%和2.08%,可能是一个新的控制旗叶长的基因位点。

• 单位
  生物工程学院; 新乡学院; 河南科技学院