动态监测婴儿肠道16S rDNA宏基因组5例报告

作者：马丽亚; 张敏; 王辉林; 陈睿; 黄艳; 梁小琴; 卢光进

来源：中国当代儿科杂志, 2014, 16(11): 1172-1176.

DOI：10.7499/j.issn.1008-8830.2014.11.022

• 宏基因组
• 测序
• 肠道菌群
• 婴儿

目的探讨婴儿肠道16S rDNA宏基因组的动态变化。方法收集5例健康婴儿生后3 d、1个月、6个月、1岁时粪便样本共17份,提取细菌总DNA,采用新一代高通量测序技术对16S rDNA的V6高变区测序并进行物种分类、丰度及多样性分析。结果 17份样品共产生原始测序数据为2 190.66 Mbp,Operational Taxonomic Units(OTU)数量36308;优势菌门包括变形菌门、厚壁菌门、拟杆菌门和放线菌门;不同婴儿间肠道菌群分布有差异;科水平>1%的物种生后3 d时24种,1个月、6个月时增至最多7种,1岁时达10种;4个时间点的npShannon和Simpson指数均值分别为1.117、1.460、2.088、2.50和0.443、0.408、0.229、0.143。结论婴儿粪便中含丰富细菌基因组;细菌物种丰度及分类存在个体差异;细菌多样性随日龄而增加,婴儿肠道菌群结构出生后逐渐趋向复杂和多样。

• 单位
  中心实验室; 深圳市宝安区妇幼保健院