科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
目的寻求费用低廉、简便、快速的方法检测广东地区汉族慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者尼古丁受体rs1051730和rs16969968单核苷酸多态性。方法收集2010年9月至2012年4月在广州医科大学附属市一人民医院、广州医科大学附属第一医院、广州医科大学附属第三医院住院及门诊受试者1 248例,从广州荔湾城区和韶关云岩、桂头农村流行病学调查的资料抽取533例,共计1 781例患者,分为COPD组1 013例,非COPD对照组768例。应用高分辨率熔解曲线(HRM)技术,对尼古丁受体基因rs1051730和rs16969968进行分型,并以焦磷酸测序法进行对照。Hardy-Weinberg定律检测rs1051730和rs16969968单核苷酸多态性(SNP)是否符合遗传平衡。结果以HRM法能够较准确、快速区别出COPD与非COPD对照者尼古丁受体rs16969968A风险等位基因频率及基因型频率的差异,HRM分析显示rs1051730分为3型,分别为CC、CT、TT型,rs16969968也分为3型,分别为GG、AG、AA型,高分辨率熔解曲线可清楚的分辨rs1051730基因型及rs16969968基因型。rs16969968风险等位基因A的基因频率在COPD患者中为4.3%,在对照组中为3.0%(P=0.043)。杂合基因型AG在COPD的基因型频率为8.6%,对照组为5.7%(P=0.025),突变型AA罕见(仅0.1%)。rs1051730风险等位基因T和等位基因频率及基因型频率与rs16969968完全相同,连锁性分析发现两位点完全相关。200例标本测序结果显示,199例HRM基因分型结果与测序相同,仅1例结果不同,与测序符合率达98%以上,两位点均符合Hardy-Weinberg平衡定律(χ2=0.178,P>0.05)。结论 HRM费用低廉、简便、快速,能准确对尼古受体rs1051730和rs16969968基因分型。
- 单位
