rno-miR-16-5p靶基因预测、生物信息学分析及鉴定

作者：王芳; 潘茂兴; 蔡三金; 梅志刚; 冯知涛^*

来源：实用医学杂志, 2019, 35(14): 2215-2219.

• rno-miR-16-5p
• 靶基因
• 生物信息学
• 脑源性神经营养因子
• 信号通路

目的对rno-miR-16-5p靶基因进行预测、生物信息学分析及鉴定,为深入研究rno-miR-16-5p的生物学功能奠定基础。方法应用TargetScan、miRDB、miRanda数据库预测出rno-miR-16-5p的靶基因,对靶基因进行基因本体论(GO)注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)生物通路富集分析,并利用双荧光素酶报告实验鉴定。结果 3个数据库预测出的交集靶基因有48个,rno-miR-16-5p靶基因主要富集于细胞生长发育、促进突触合成及神经系统发育等生物过程,富集于血小板α颗粒、细胞质动力蛋白复合体等细胞组件与粘多糖分子功能中。信号通路则显著富集于唾液分泌通路、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号通路、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路与胰腺分泌通路。双荧光素酶报告实验结果提示脑源性神经营养因子(BDNF)是rno-miR-16-5p的靶基因。结论 rno-miR-16-5p靶向作用于BDNF的表达,可能通过参与cAMP信号通路促进神经系统发育的生物学过程。

• 单位
  暨南大学; 国家中医药管理局; 三峡大学