本发明公开了一种基于计算机模拟可控生成缺陷网状骨架材料模型的方法,该方法包括标记节点与配体的对接原子、识别和删除对接原子之间的化学键、生成材料的网络近邻列表、定量控制缺陷含量和分布、重建连接键和删除孤立节点。本发明方法适用于多种类型网状骨架材料缺陷结构的构建,能够高效快速地、定量地遍历网状骨架材料缺陷的含量和分布范围,可大批量生成一系列缺陷结构,为后续从统计学角度系统地研究缺陷网状骨架材料的定量构效关系提供高质量的理论模型。