在当前市场宏观调控较为频繁的背景下,事业单位的经营环境也越发复杂。财务核算作为事业单位财务管理工作的核心以及事业单位实现财务效益的关键,本文首先分析新政府会计制度的落实给事业单位财务核算带来的影响,并阐述了事业单位加强财务核算的重要性,再分析了现阶段事业单位财务核算工作开展中存在的难题,最后结合实践经验,对事业单位在新政府会计制度下提高财务核算水平提出了相应的对策建议。