牛HoxC9基因CDS区克隆及表达谱分析

作者：高晓茜; 雷召雄; 唐林; 汪书哲; 杨梦丽; 马云^*

来源：河北农业大学学报, 2021, 44(03): 73-78.

DOI：10.13320/j.cnki.jauh.2021.0050

• 牛
• HoxC9
• 脂肪细胞
• qPCR
• 生物信息学分析

本研究旨在克隆牛HoxC9基因的CDS区,并分析其生物信息学特征,检测HoxC9在牛7种组织(心、肝、脾、肺、肾、肌肉和背脂)和原代脂肪细胞分化过程(0～10 d)中的表达规律,采用PCR法获得牛HoxC9基因的CDS区,利用ProtPram、TMpred、ProtFun 2.1 Server等在线网站对HoxC9蛋白进行生物信息学分析,qPCR检测HoxC9在牛不同组织以及原代脂肪细胞分化过程中的表达量。结果表明,牛HoxC9基因CDS区全长783 bp,编码260个氨基酸,是能发生核质转位的亲水性蛋白,其氨基酸序列主要由无规卷曲和α-螺旋构成。HoxC9在牛背脂中的表达量相对其他组织(心、肝、脾、肺、肾、肌肉)较高;随着细胞分化时间的推移,以0d为对照,HoxC9的表达水平在第4天达到最高(P<0.01),第6天开始逐渐降低,在第8天表达水平达到最低。该研究结果为进一步揭示牛HoxC9基因的功能提供基础资料。

• 单位
  宁夏大学