2018-2020年福建地区猪瘟病毒E0基因遗传变异分析

作者：戴爱玲; 张鑫杰; 林楚云; 尹会方; 薛少华; 刘建奎; 杨小燕

来源：中国动物传染病学报, 2022, 1-10.

DOI：10.19958/j.cnki.cn31-2031/s.20220826.001

• 猪瘟病毒
• RT-nPCR
• E0基因
• 遗传变异

为了了解2018-2020年福建地区猪瘟病毒流行及遗传变异情况，收集福建省不同地区临床发病猪的血液和肺、脾、淋巴结等组织样本1464份，采用RT-nPCR的方法对样品进行CSFV检测，对部分CSFV阳性样品E0基因进行克隆测序。结果显示，CSFV总体阳性率为1.9%（29/1464），并获得13株CSFV E0基因序列。同源性分析发现所得13株CSFV E0基因之间的同源性在82.2%-99.7%，其中11株CSFV E0基因与1.1亚型代表毒株HCLV的核苷酸同源性为99.0%-99.9%，与Shimen株的核苷酸同源性94.1%-95.0%；1株与2.1c型参考毒株HNSD-2012核苷酸同源性为98.2%；1株与2.1d亚型毒株CSFV/JPN/2018核苷酸同源性为99.6%。遗传进化分析发现，10株CSFV与HCLV、C-ZJ-2008、Shimen和Brescia处于同一分支，属于1.1亚型；1株CSFV与HNSD-2012等位于同一分支，属于2.1c亚亚型；1株与CSFV/JPN/2018等位于同一分支，属于2.1d亚亚型。氨基酸序列分析发现，13株毒株与HCLV等代表毒株在重要的Rnase活性位点高度保守，其中2株2.1亚型毒株与HCLV毒株相比，其在第35位非关键氨基酸残基上发生由G→ E的突变。结果表明福建地区CSFV流行情况趋向多样化，提示仍需加强对CSFV流行及遗传变异的持续监测，为猪瘟的诊断及有效防控奠定基础。

• 单位
  生命科学学院; 龙岩学院