基于稠密网络的DNA结合蛋白质预测方法

作者:李国斌; 杜秀全; 李新路; 吴志泽
来源:重庆科技学院学报(自然科学版), 2020, 22(05): 81-85.
DOI:10.19406/j.cnki.cqkjxyxbzkb.2020.05.017

摘要

提出了一种基于深度学习的DNA结合蛋白识别方法(DBP-DenseNet)。以稠密网络代替传统的金字塔式卷积神经网络(CNN)结构,将上一层的特征信息整合到下一层,利用层间的特征融合来学习整个氨基酸序列的综合特征;由双向长短期记忆网络(Bi-LSTM)负责在氨基酸序列上下文中获取长期依赖关系。实验结果表明,稠密连接可以有效提高模型的特征表达能力。