基于全基因组重测序技术的甘蓝型油菜光叶突变体基因定位

作者：文雁成^*; 何俊平; 蔡东芳; 张书芬; 朱家成; 王建平; 曹金华; 赵磊; 王东国; 刘奕孜

来源：浙江大学学报(农业与生命科学版), 2023, 49(04): 497-506.

• 甘蓝型油菜
• 光叶突变体
• 全基因组重测序
• 基因定位

表皮蜡质是油菜适应逆境的保护措施之一。本课题组前期报道了一个由1对显性基因控制的甘蓝型油菜(Brassica napus L.)光叶突变体DL22B077-1。为了进一步了解其遗传机制，本研究利用全基因组重测序技术和分离群体分析法(bulk segregated analysis,BSA)通过F2群体进行基因定位，获得的有效碱基数达10 661.75 Mb，其中，Q30均值为92.99%，平均作图率为97.73%，平均测序深度为24×，平均覆盖率为82.06%，测序质量较高；此外，分析了单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)标记和插入-缺失(insertion-deletion,In-Del)标记与光叶性状的相关性。通过SNP标记，在5条染色体上得到7个相关区域和1 509个相关基因。通过In-Del标记，在11条染色体上得到15个相关区域和2 633个相关基因。SNP标记和In-Del标记关联分析结果的交集部分为C8染色体上8.60～10.39 Mb区域，总长度为1.79 Mb，共计130个候选基因，其中119个基因得到注释，它们参与了细胞成分的构建，确保了分子功能和生物过程的顺利进行。DL22B077-1是第一个将蜡质基因定位到C8染色体上的甘蓝型油菜光叶突变体，据此判断其为新的光叶突变体。上述结果为选育高产稳产油菜品种、改良油菜抗逆栽培技术奠定了理论基础。

• 单位
  河南省农业科学院