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摘要
目的 了解2018—2020年甘肃省A组轮状病毒（RVA）流行特征及全基因组特征。方法 选取甘肃省腹泻症候群监测的6家哨点医院采集的腹泻患者粪便2553份，经实时聚合酶链式反应检测A组轮状病毒、诺如病毒、腺病毒、星状病毒、札如病毒核酸，选取部分轮状病毒阳性样本构建DNA测序文库，采用第二代测序，并进行分析。结果 共检出病毒阳性标本853份，检出率33.41%，其中轮状病毒阳性率最高（17.43%），其次是诺如病毒（12.65%）、腺病毒（6.58%）、星状病毒（4.70%）、札如病毒（1.02%）。对50份轮状病毒阳性标本进行第二代测序，获得31株全序列，其中24株G9P[8]、2株G2P[8]、3株G2P[4]、1株G9P[6]和1株G9P[4]型别。全基因组核苷酸序列分析发现，除VP7片段外，序列差异比较大的有VP3和NSP4两个节段。本研究获得21株G9P[8]型Wa-like株(G9-P[8]-I1-R1-C1-M 1-A1-N1-T1-E1-H1),3株NSP4节段重配的G9P[8]-E2株(G9-P[8]-I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E2-H1)，在测序的24株G9P[8]型RVA毒株中，G9P[8]-E2重配株占12.5%(3/24)。结论 2018—2020年甘肃省轮状病毒是儿童腹泻的主要病原体，以G9P[8]基因型为绝对优势，首次发现G9P[8]-E2重配株，应持续进行病毒变异的监测。
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单位甘肃省疾病预防控制中心; 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
